1.14. Un contribuyente que aplique el SII y haya optado por facturar a través de su cliente o un tercero ¿debe comunicarlo a la AEAT?

Sí. Deberá comunicarlo mediante el modelo 036 a partir del mes de junio de 2017, marcando la casilla 740, indicando en la casilla 739 (página 5) la fecha del acuerdo (previamente se debe marcar en la página 1 la causa 123 “Modificación de datos relativos al IVA”). En caso de que la facturación por terceros sea consecuencia de una obligación normativa, la fecha que se deberá indicar será la de la entrada en vigor de la disposición normativa que lo exige.

Fuente: Agencia Tributaria